Crkva na glavnom trgu Pečuja je danas arhitektonski znamen grada. Nakon osmanlijske okupacije 1543. godine je gotska parohija ovde srušena i na njenom mestu podignuta „Mošeja pobedonosnog Kasim paše Gazija“. Ona je najveći očuvani spomenik osmanlijske arhitekture u Mađarskoj. 12. oktobra 1686. godine, nakon što su austrijske trupe pod vođstvom Ludviga markgrofa od Badena (Ludwig Markgraf von Baden) osvojile grad natrag, oficiri su se povukli u ovu džamiju i tamo pevali Te deum.

Mošeju krajem 17. stoleća dobija Jezuitski orden, koji je i u Pečuju osnovao jedan svoj ogranak. Ovaj je zgradu po katoličkim propisima prezidao u kršćansku crkvu.

1780. godine Marija Terezija (Maria Theresia) proglašava Pečuj slobodnim kraljevskim gradom. Od onda je nekadašnja džamija rimokatolička parohija u središtu grada. Dopuna zgrade na severozapadnoj strani crkve sa njenim polukružnim nacrtom je obavljena između 1939. i 1941. godine.

Od 1989. g. se nedeljom ovde ponovo održavaju božje službe na nemačkom jeziku; do sada uvek u 8.30 ujutro.